Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 VPS15YBR097W 4365 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 MSH6YDR097C 3729 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 SPT21YMR179W 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 BRE1YDL074C 2103 nt2.01□□□□□ -2.09 RIP-Chip
NOP56Q12460 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 HIR3YJR140C 4947 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 DGR2YKL121W 2559 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 SSS1YDR086C 243 nt2□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 NAB6YML117W 3405 nt2□□□□□ -2.09 RIP-Chip
NOP56Q12460 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YBL012CYBL012C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 DGR1YNL130C-A 147 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 APL2YKL135C 2181 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 NIP100YPL174C 2607 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 LHS1YKL073W 2646 nt1.98□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 ENV11YGR071C 2583 nt1.98□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 snR49snR49 165 nt1.98□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 PIG1YLR273C 1947 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 VIK1YPL253C 1944 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 YNL028WYNL028W 318 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 CSE2YNR010W 450 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 UTP21YLR409C 2820 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 PEP1YBL017C 4740 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 SPC98YNL126W 2541 nt1.96□□□□□ -2.09
NOP56Q12460 TFC3YAL001C 3483 nt1.96□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 SAP190YKR028W 3102 nt1.96□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 TDA9YML081W 3756 nt1.96□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 APL5YPL195W 2799 nt1.95□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 MAD1YGL086W 2250 nt1.95□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.95□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 SLN1YIL147C 3663 nt1.95□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 RAD34YDR314C 2079 nt1.94□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 SFB2YNL049C 2631 nt1.94□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 MPT5YGL178W 2580 nt1.94□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YCK3YER123W 1575 nt1.93□□□□□ -2.1 RIP-Chip
NOP56Q12460 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.93□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 PAU2YEL049W 363 nt1.93□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YJR039WYJR039W 3366 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YFR016CYFR016C 3702 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 PAU3YCR104W 375 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 INA22YIR024C 651 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YBR064WYBR064W 429 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 UTP22YGR090W 3714 nt1.92□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 RPL34BYIL052C 366 nt1.91□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 ATP7YKL016C 525 nt1.91□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 UFD4YKL010C 4452 nt1.91□□□□□ -2.1
NOP56Q12460 YIR044CYIR044C 186 nt1.9□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.9□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.9□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YPP1YGR198W 2454 nt1.9□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 SPG3YDR504C 384 nt1.89□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.89□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 PKH3YDR466W 2697 nt1.89□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 PDE2YOR360C 1581 nt1.89□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YGL052WYGL052W 306 nt1.88□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 ABF2YMR072W 552 nt1.88□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.88□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 CUL3YGR003W 2235 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 NOC3YLR002C 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 snR55snR55 98 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 snR80snR80 171 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YMR321CYMR321C 318 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YOR218CYOR218C 420 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 INO80YGL150C 4470 nt1.87□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 VPS54YDR027C 2670 nt1.86□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 RPS27BYHR021C 249 nt1.86□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 SBE22YHR103W 2559 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YGL041CYGL041C 204 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 YOR015WYOR015W 360 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 IES4YOR189W 351 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 PTP2YOR208W 2253 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 CDC36YDL165W 576 nt1.84□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 EMC5YIL027C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 RPS25BYLR333C 327 nt1.84□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 SPO24YPR036W-A 204 nt1.84□□□□□ -2.11
NOP56Q12460 SPO75YLL005C 2607 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 SLI15YBR156C 2097 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 SEC5YDR166C 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 ATG11YPR049C 3537 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 SEC31YDL195W 3822 nt1.82□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YLL007CYLL007C 1998 nt1.82□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 BPH1YCR032W 6504 nt1.81□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 RPL31AYDL075W 342 nt1.81□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YJL120WYJL120W 324 nt1.81□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 RAD50YNL250W 3939 nt1.81□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 SPO21YOL091W 1830 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 COG4YPR105C 2586 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 JLP2YMR132C 627 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YPR092WYPR092W 306 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 SKI3YPR189W 4299 nt1.8□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 PKH2YOL100W 3246 nt1.79□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 GPG1YGL121C 381 nt1.79□□□□□ -2.12
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