Protein–RNA interactions for Protein: Q12421

ATG31, Autophagy-related protein 31, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG31Q12421 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YPL182CYPL182C 384 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YPR153WYPR153W 423 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 DBP6YNR038W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 SEC1YDR164C 2175 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 RPL9AYGL147C 576 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YJR003CYJR003C 1560 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 COG4YPR105C 2586 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 ISD11YER048W-A 285 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 PRE4YFR050C 801 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 SWF1YDR126W 1011 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 GPG1YGL121C 381 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YAR009CYAR009C 3591 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG31Q12421 YCR001WYCR001W 315 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 GPI15YNL038W 690 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 PRP16YKR086W 3216 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 RPB10YOR210W 213 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 PAN2YGL094C 3348 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 PAM16YJL104W 450 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YKL202WYKL202W 582 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 GEA2YEL022W 4380 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 NHP2YDL208W 471 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 TIM13YGR181W 318 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YGR042WYGR042W 816 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YJL135WYJL135W 318 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 EAF6YJR082C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 PBI2YNL015W 228 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YOR282WYOR282W 321 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 PKH2YOL100W 3246 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 RKR1YMR247C 4689 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YLL007CYLL007C 1998 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YLR269CYLR269C 351 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 ECM12YHR021W-A 456 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 CMC4YMR194C-B 222 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 LOA1YPR139C 903 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG31Q12421 YDR521WYDR521W 336 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YHL042WYHL042W 453 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YPL261CYPL261C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 PAC1YOR269W 1485 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 RPF1YHR088W 888 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 RPL38YLR325C 237 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YOL160WYOL160W 342 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YHR125WYHR125W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 NFU1YKL040C 771 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YML108WYML108W 318 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 CUL3YGR003W 2235 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 EMC4YGL231C 573 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 YIR044CYIR044C 186 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG31Q12421 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YBL071CYBL071C 309 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 RAD34YDR314C 2079 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 PMP1YCR024C-A 123 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 snR72snR72 98 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YDL011CYDL011C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YLR287CYLR287C 1068 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 RPL26AYLR344W 384 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 CDC33YOL139C 642 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 snR51snR51 107 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 NPR2YEL062W 1848 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YHR130CYHR130C 336 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 STE18YJR086W 333 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 ZEO1YOL109W 342 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 NOP9YJL010C 2001 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YDR344CYDR344C 444 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 WIP1YDR374W-A 270 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YPL044CYPL044C 549 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 YPL229WYPL229W 621 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG31Q12421 SDH7YDR511W 402 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG31Q12421 YNR025CYNR025C 360 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG31Q12421 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG31Q12421 CHS6YJL099W 2241 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG31Q12421 AIM29YKR074W 468 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG31Q12421 INP2YMR163C 2118 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.7 ms