Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 VIK1YPL253C 1944 nt1.95□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 BPH1YCR032W 6504 nt1.95□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 RTT107YHR154W 3213 nt1.95□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 BRR2YER172C 6492 nt1.94□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 FAB1YFR019W 6837 nt1.94□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.94□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 MDM20YOL076W 2391 nt1.94□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 MAK10YEL053C 2202 nt1.94□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YLR422WYLR422W 5799 nt1.93□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 SRP14YDL092W 441 nt1.93□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YNL337WYNL337W 255 nt1.93□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.92□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 INA22YIR024C 651 nt1.92□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.92□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.92□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 TUS1YLR425W 3924 nt1.92□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 ELG1YOR144C 2376 nt1.91□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.91□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YGL052WYGL052W 306 nt1.91□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 IST2YBR086C 2841 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 IRE1YHR079C 3348 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 SAS3YBL052C 2496 nt1.9□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 IRC20YLR247C 4671 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 PAU2YEL049W 363 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YBL012CYBL012C 402 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YOL160WYOL160W 342 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 UBR2YLR024C 5619 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 MPT5YGL178W 2580 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 PDE2YOR360C 1581 nt1.89□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 CTR9YOL145C 3234 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 MSC6YOR354C 2079 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YDL118WYDL118W 381 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 GPG1YGL121C 381 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 PFD1YJL179W 330 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YMR321CYMR321C 318 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YOR015WYOR015W 360 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 IES4YOR189W 351 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 FKS1YLR342W 5631 nt1.88□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 NIP100YPL174C 2607 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 SAC3YDR159W 3906 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 ZIP2YGL249W 2115 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 HMI1YOL095C 2121 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YCK3YER123W 1575 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 HSH155YMR288W 2916 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 SPC98YNL126W 2541 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 MSH5YDL154W 2706 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 FIG2YCR089W 4830 nt1.87□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 CAT2YML042W 2013 nt1.86□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 MLH3YPL164C 2148 nt1.86□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 NPR2YEL062W 1848 nt1.86□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 GCN2YDR283C 4980 nt1.86□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 BUD2YKL092C 3315 nt1.85□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 RLM1YPL089C 2031 nt1.85□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 VPS54YDR027C 2670 nt1.85□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 AGC1YPR021C 2709 nt1.85□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 PMD1YER132C 5262 nt1.84□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 DNF3YMR162C 4971 nt1.84□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 FRK1YPL141C 2598 nt1.84□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.84□□□□□ -2.11
LCB4Q12246 HIR3YJR140C 4947 nt1.84□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.83□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YOR218CYOR218C 420 nt1.83□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 MSH6YDR097C 3729 nt1.83□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 RPS27BYHR021C 249 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 APQ12YIL040W 417 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YPR092WYPR092W 306 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 CFT1YDR301W 4074 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 ENV11YGR071C 2583 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 ATG9YDL149W 2994 nt1.82□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 MYO4YAL029C 4416 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 DGR2YKL121W 2559 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 APL2YKL135C 2181 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 RPL34BYIL052C 366 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YOR302WYOR302W 78 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 TRM3YDL112W 4311 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 RAD34YDR314C 2079 nt1.81□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 MAD1YGL086W 2250 nt1.8□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.8□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 PAM16YJL104W 450 nt1.8□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 PIG1YLR273C 1947 nt1.79□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 SEY1YOR165W 2331 nt1.79□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 MGA2YIR033W 3342 nt1.79□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 SEC63YOR254C 1992 nt1.78□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 YNL198CYNL198C 303 nt1.78□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 SEC5YDR166C 2916 nt1.78□□□□□ -2.12
LCB4Q12246 SPO75YLL005C 2607 nt1.77□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 SFB2YNL049C 2631 nt1.77□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 PDR8YLR266C 2106 nt1.77□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YOR225WYOR225W 330 nt1.77□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 NOC3YLR002C 1992 nt1.77□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 RPS25BYLR333C 327 nt1.76□□□□□ -2.13
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