Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 CYC7YEL039C 342 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 ZIP2YGL249W 2115 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YLR101CYLR101C 396 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 CDC33YOL139C 642 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 PDE2YOR360C 1581 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 AIM9YER080W 1884 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 BEM2YER155C 6504 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 LCD1YDR499W 2244 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.1□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.1□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 SPO75YLL005C 2607 nt1.1□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 PAN2YGL094C 3348 nt1.09□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 RTT102YGR275W 474 nt1.09□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YPL229WYPL229W 621 nt1.09□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 KAP120YPL125W 3099 nt1.08□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YPL261CYPL261C 309 nt1.08□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 FIG4YNL325C 2640 nt1.07□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 SPT7YBR081C 3999 nt1.07□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 RIM20YOR275C 1986 nt1.07□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YJR003CYJR003C 1560 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YML003WYML003W 873 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YOR199WYOR199W 330 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 RPB10YOR210W 213 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 snR41snR41 95 nt1.06□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 STO1YMR125W 2586 nt1.05□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 IFH1YLR223C 3258 nt1.05□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 COG4YPR105C 2586 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 WIP1YDR374W-A 270 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 ATP19YOL077W-A 207 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 CDC39YCR093W 6327 nt1.04□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YDL206WYDL206W 2289 nt1.03□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 CBS1YDL069C 690 nt1.03□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 GPG1YGL121C 381 nt1.03□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YIR044CYIR044C 186 nt1.03□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YOL160WYOL160W 342 nt1.03□□□□□ -2.24
NFI1Q12216 YJL135WYJL135W 318 nt1.02□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YAR047CYAR047C 321 nt1.02□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YNL058CYNL058C 951 nt1.02□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 TOM22YNL131W 459 nt1.02□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 MRPL50YNR022C 420 nt1.01□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.01□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 IML1YJR138W 4755 nt1.01□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YKL063CYKL063C 504 nt1□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 IRC23YOR044W 474 nt1□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 SIP4YJL089W 2490 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YJL007CYJL007C 315 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YKL083WYKL083W 615 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 snR51snR51 107 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YGR130CYGR130C 2451 nt0.99□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 SLD3YGL113W 2007 nt0.98□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 SDH7YDR511W 402 nt0.98□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 INP2YMR163C 2118 nt0.97□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 WAR1YML076C 2835 nt0.97□□□□□ -2.25
NFI1Q12216 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.96□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 YAR009CYAR009C 3591 nt0.96□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 RAD34YDR314C 2079 nt0.96□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 CUL3YGR003W 2235 nt0.96□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 UBC7YMR022W 498 nt0.95□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 PKH2YOL100W 3246 nt0.95□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 SMC1YFL008W 3678 nt0.95□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 YAP6YDR259C 1152 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 ISD11YER048W-A 285 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 YHL042WYHL042W 453 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 RPS24BYIL069C 408 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 HCH1YNL281W 462 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 Q0017Q0017 162 nt0.94□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 ANS1YHR126C 480 nt0.93□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 snR72snR72 98 nt0.92□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 PCF11YDR228C 1881 nt0.92□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 ATG31YDR022C 591 nt0.91□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.91□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 YLR456WYLR456W 615 nt0.91□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 TTI1YKL033W 3117 nt0.91□□□□□ -2.26
NFI1Q12216 ISF1YMR081C 1017 nt0.9□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YPL185WYPL185W 396 nt0.9□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 PRP16YKR086W 3216 nt0.9□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YDL073WYDL073W 2955 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YDL196WYDL196W 330 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 RPS20YHL015W 366 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YHL041WYHL041W 450 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 RPL38YLR325C 237 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YOR282WYOR282W 321 nt0.89□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 PAC1YOR269W 1485 nt0.88□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 ALG13YGL047W 609 nt0.88□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 RPL26AYLR344W 384 nt0.88□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 PTP2YOR208W 2253 nt0.88□□□□□ -2.27
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