Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 MRPL50YNR022C 420 nt1.13□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YOL014WYOL014W 375 nt1.13□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 SGO1YOR073W 1773 nt1.13□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YGL239CYGL239C 315 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 HIT1YJR055W 495 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.12□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 RAD50YNL250W 3939 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YDR114CYDR114C 303 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YGR042WYGR042W 816 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 RPS24BYIL069C 408 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YLL020CYLL020C 306 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 RPL9BYNL067W 576 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 LEE1YPL054W 906 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 SWI4YER111C 3282 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 PXA2YKL188C 2562 nt1.11□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YHR138CYHR138C 345 nt1.1□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 RPL26AYLR344W 384 nt1.1□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 BIR1YJR089W 2865 nt1.1□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 DIE2YGR227W 1578 nt1.09□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 HDA3YPR179C 1968 nt1.09□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 AGA2YGL032C 264 nt1.09□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YGL217CYGL217C 342 nt1.09□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.09□□□□□ -2.23
TY3A-GQ12173 SLX4YLR135W 2247 nt1.09□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YMR160WYMR160W 2451 nt1.09□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 TOF2YKR010C 2316 nt1.09□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 SWF1YDR126W 1011 nt1.08□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YAP6YDR259C 1152 nt1.08□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YOP1YPR028W 543 nt1.08□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YDR269CYDR269C 324 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 RPL34BYIL052C 366 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 SPO23YBR250W 1572 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 SWI5YDR146C 2130 nt1.07□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 ZIP1YDR285W 2628 nt1.06□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YDL011CYDL011C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 RTR1YER139C 681 nt1.06□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YNL324WYNL324W 396 nt1.06□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.05□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 CYC7YEL039C 342 nt1.05□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 RRT1YBL048W 312 nt1.05□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 LYS14YDR034C 2373 nt1.05□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 ENV11YGR071C 2583 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 CDC39YCR093W 6327 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YBR285WYBR285W 435 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 NUP188YML103C 4968 nt1.04□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 NOC3YLR002C 1992 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 TIM13YGR181W 318 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 snR14snR14 160 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YPL182CYPL182C 384 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 YPL185WYPL185W 396 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 NUT1YGL151W 3399 nt1.03□□□□□ -2.24
TY3A-GQ12173 SPT21YMR179W 2277 nt1.03□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.02□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YHL041WYHL041W 450 nt1.02□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 AIM44YPL158C 2277 nt1.01□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YKL063CYKL063C 504 nt1.01□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.01□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 PRP16YKR086W 3216 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YKL202WYKL202W 582 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 SDH2YLL041C 801 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YAR047CYAR047C 321 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 UPS1YLR193C 528 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 BSC3YLR465C 309 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 NUT2YPR168W 474 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 PCF11YDR228C 1881 nt1□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 EAF1YDR359C 2949 nt0.99□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 KAP120YPL125W 3099 nt0.99□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 ATG31YDR022C 591 nt0.99□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YIL059CYIL059C 366 nt0.99□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 MYO1YHR023W 5787 nt0.99□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YLL032CYLL032C 2478 nt0.98□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YFL019CYFL019C 354 nt0.98□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YKL083WYKL083W 615 nt0.98□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 MRPL31YKL138C 396 nt0.98□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 RFX1YLR176C 2436 nt0.98□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 PIG1YLR273C 1947 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 snR72snR72 98 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YMR321CYMR321C 318 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YOR053WYOR053W 342 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 YBR012CYBR012C 420 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 AIM9YER080W 1884 nt0.97□□□□□ -2.25
TY3A-GQ12173 APL3YBL037W 3078 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 MPT5YGL178W 2580 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YJL135WYJL135W 318 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.96□□□□□ -2.26
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