Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 PAC1YOR269W 1485 nt1.53□□□□□ -2.16
RIM20Q12033 MVP1YMR004W 1536 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YGR035CYGR035C 351 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 RPL38YLR325C 237 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 snR51snR51 107 nt1.52□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YLR140WYLR140W 327 nt1.51□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YOR376WYOR376W 369 nt1.51□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SPC98YNL126W 2541 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 TIM18YOR297C 579 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SPC110YDR356W 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 NOC3YLR002C 1992 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 RAD50YNL250W 3939 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 TRM732YMR259C 4263 nt1.5□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SGO1YOR073W 1773 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SXM1YDR395W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YGL217CYGL217C 342 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 RPB10YOR210W 213 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SMC4YLR086W 4257 nt1.49□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.48□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 EST2YLR318W 2655 nt1.48□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.48□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 VPS54YDR027C 2670 nt1.48□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 INP2YMR163C 2118 nt1.48□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SEC5YDR166C 2916 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SDH2YLL041C 801 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YAR053WYAR053W 297 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YOR199WYOR199W 330 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 POL5YEL055C 3069 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 MSN5YDR335W 3675 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 SLX4YLR135W 2247 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 PIK1YNL267W 3201 nt1.47□□□□□ -2.17
RIM20Q12033 ZIP2YGL249W 2115 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YOL160WYOL160W 342 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YSY6YBR162W-A 198 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 AHC1YOR023C 1701 nt1.46□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 FYV8YGR196C 2454 nt1.45□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 RIM20YOR275C 1986 nt1.45□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 snR72snR72 98 nt1.45□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 RPS20YHL015W 366 nt1.45□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 RPL33BYOR234C 324 nt1.44□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YPR197CYPR197C 564 nt1.44□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 ALY2YJL084C 3141 nt1.44□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 MAD1YGL086W 2250 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YLL054CYLL054C 2532 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 NPC2YDL046W 522 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YJL015CYJL015C 285 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YJL135WYJL135W 318 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 BIL1YOR304C-A 231 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 SCW11YGL028C 1629 nt1.43□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 HKR1YDR420W 5409 nt1.42□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 NIP100YPL174C 2607 nt1.42□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 CSN9YDR179C 489 nt1.42□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 CLU1YMR012W 3834 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 SWI4YER111C 3282 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 Q0142Q0142 177 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 PCC1YKR095W-A 267 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 AZF1YOR113W 2745 nt1.41□□□□□ -2.18
RIM20Q12033 RAD34YDR314C 2079 nt1.39□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 SLI15YBR156C 2097 nt1.39□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YDL211CYDL211C 1119 nt1.39□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YAF9YNL107W 681 nt1.39□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 snR14snR14 160 nt1.39□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YGR130CYGR130C 2451 nt1.38□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YDR426CYDR426C 378 nt1.38□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 SPT21YMR179W 2277 nt1.38□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 MPT5YGL178W 2580 nt1.37□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 PIP2YOR363C 2991 nt1.37□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YPL225WYPL225W 441 nt1.37□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 NUP188YML103C 4968 nt1.37□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 LCD1YDR499W 2244 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 RPL35AYDL191W 363 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YIR044CYIR044C 186 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 MDS3YGL197W 4464 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 COG4YPR105C 2586 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 IML1YJR138W 4755 nt1.36□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 APL3YBL037W 3078 nt1.35□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.34□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.34□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 MAM33YIL070C 801 nt1.34□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 RRT15YLR162W-A 189 nt1.34□□□□□ -2.19
RIM20Q12033 IFH1YLR223C 3258 nt1.34□□□□□ -2.2
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