Protein–RNA interactions for Protein: Q12024

YTM1, Ribosome biogenesis protein YTM1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTM1Q12024 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.03□□□□□ -2.08
YTM1Q12024 SPT21YMR179W 2277 nt2.03□□□□□ -2.08
YTM1Q12024 MPT5YGL178W 2580 nt2.03□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YBL012CYBL012C 402 nt2.02□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YJR039WYJR039W 3366 nt2.02□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YNL144CYNL144C 2223 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 SPP41YDR464W 4308 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 ATP7YKL016C 525 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 DGR1YNL130C-A 147 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 TOR2YKL203C 7425 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 MAD1YGL086W 2250 nt2.01□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 BRE1YDL074C 2103 nt2□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 MCD1YDL003W 1701 nt2□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 RAD34YDR314C 2079 nt2□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 PUT3YKL015W 2940 nt2□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 SFB2YNL049C 2631 nt2□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 VIK1YPL253C 1944 nt1.99□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 UTP21YLR409C 2820 nt1.99□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 PAU2YEL049W 363 nt1.99□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YCK3YER123W 1575 nt1.98□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 UBR2YLR024C 5619 nt1.98□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 UFD4YKL010C 4452 nt1.98□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YNL028WYNL028W 318 nt1.98□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 CSE2YNR010W 450 nt1.98□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.97□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 INA22YIR024C 651 nt1.97□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 TMA7YLR262C-A 195 nt1.97□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 snR49snR49 165 nt1.97□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 TBS1YBR150C 3285 nt1.97□□□□□ -2.09
YTM1Q12024 YMR045CYMR045C 5268 nt1.96□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.96□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 RPL34BYIL052C 366 nt1.96□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 LHS1YKL073W 2646 nt1.95□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YFR016CYFR016C 3702 nt1.95□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 SEC31YDL195W 3822 nt1.95□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 PAU3YCR104W 375 nt1.94□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YIR044CYIR044C 186 nt1.94□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 NOC3YLR002C 1992 nt1.94□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 HSL1YKL101W 4557 nt1.93□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.93□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YBR064WYBR064W 429 nt1.93□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 UBP15YMR304W 3693 nt1.93□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 ELG1YOR144C 2376 nt1.92□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 EMC5YIL027C 426 nt1.92□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 SPO75YLL005C 2607 nt1.92□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 FKS1YLR342W 5631 nt1.92□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 GYP5YPL249C 2685 nt1.92□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YOR015WYOR015W 360 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 SPO24YPR036W-A 204 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 INO80YGL150C 4470 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 SKI3YPR189W 4299 nt1.91□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 FAB1YFR019W 6837 nt1.9□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 PDE2YOR360C 1581 nt1.9□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 VPS54YDR027C 2670 nt1.9□□□□□ -2.1
YTM1Q12024 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.9□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YMR321CYMR321C 318 nt1.9□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 CUL3YGR003W 2235 nt1.89□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YGL052WYGL052W 306 nt1.89□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 UBP2YOR124C 3819 nt1.89□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 SLI15YBR156C 2097 nt1.88□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 RPS27BYHR021C 249 nt1.88□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 IES4YOR189W 351 nt1.88□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 NUT1YGL151W 3399 nt1.88□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 KCS1YDR017C 3153 nt1.88□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 GCN2YDR283C 4980 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 RPL31AYDL075W 342 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 snR80snR80 171 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YJL120WYJL120W 324 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 RPS25BYLR333C 327 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 ABF2YMR072W 552 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YOR218CYOR218C 420 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 PTP2YOR208W 2253 nt1.87□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 BPH1YCR032W 6504 nt1.86□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.86□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 REV3YPL167C 4515 nt1.86□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 SPO21YOL091W 1830 nt1.86□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 COG4YPR105C 2586 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 RAD50YNL250W 3939 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 snR55snR55 98 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YLL007CYLL007C 1998 nt1.85□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YGL041CYGL041C 204 nt1.84□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 YCL023CYCL023C 348 nt1.84□□□□□ -2.11
YTM1Q12024 UFD2YDL190C 2886 nt1.84□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 MON2YNL297C 4911 nt1.84□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 SEC5YDR166C 2916 nt1.84□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 PKH3YDR466W 2697 nt1.84□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YLR419WYLR419W 4308 nt1.83□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 SPG3YDR504C 384 nt1.83□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.83□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 ALK1YGL021W 2283 nt1.82□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YGL217CYGL217C 342 nt1.82□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YJL022WYJL022W 309 nt1.82□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 COF1YLL050C 432 nt1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.9 ms