Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPSF1Q10570 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF1Q10570 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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