Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELP6Q0PNE2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP6Q0PNE2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms