Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM27E3Q08E93 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms