Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDR1Q08345 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDR1Q08345 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms