Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms