Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 NOC3YLR002C 1992 nt0.95□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 RAD50YNL250W 3939 nt0.95□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SGO1YOR073W 1773 nt0.95□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 CLU1YMR012W 3834 nt0.95□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 TRM732YMR259C 4263 nt0.95□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 VPS54YDR027C 2670 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SMC4YLR086W 4257 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 PET127YOR017W 2403 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 RPL38YLR325C 237 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 HUG1YML058W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SPO75YLL005C 2607 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SEC5YDR166C 2916 nt0.94□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YPR117WYPR117W 7470 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 TTI1YKL033W 3117 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YJR003CYJR003C 1560 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 STF2YGR008C 255 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YHL041WYHL041W 450 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YJL015CYJL015C 285 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SDH2YLL041C 801 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YNL058CYNL058C 951 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YPL261CYPL261C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YSY6YBR162W-A 198 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 snR51snR51 107 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SLX4YLR135W 2247 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 PIP2YOR363C 2991 nt0.93□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 RPB10YOR210W 213 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YPR012WYPR012W 255 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YLL054CYLL054C 2532 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 ALY2YJL084C 3141 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 PAC1YOR269W 1485 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 IML1YJR138W 4755 nt0.92□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 ZIP2YGL249W 2115 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 FYV8YGR196C 2454 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 SWI4YER111C 3282 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 ATG31YDR022C 591 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 IRC23YOR044W 474 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 AZF1YOR113W 2745 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 BPH1YCR032W 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 INP2YMR163C 2118 nt0.91□□□□□ -2.26
RDS3Q06835 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 HKR1YDR420W 5409 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YGR035CYGR035C 351 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YOL160WYOL160W 342 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YOR199WYOR199W 330 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.9□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SCW11YGL028C 1629 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RIM20YOR275C 1986 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 snR72snR72 98 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 NPC2YDL046W 522 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YDL211CYDL211C 1119 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YJL135WYJL135W 318 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 PIK1YNL267W 3201 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SPT21YMR179W 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SPT7YBR081C 3999 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RPS20YHL015W 366 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RPL33BYOR234C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 AHC1YOR023C 1701 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SLI15YBR156C 2097 nt0.88□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 NIP100YPL174C 2607 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YLL020CYLL020C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 snR14snR14 160 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 MPT5YGL178W 2580 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 NUP188YML103C 4968 nt0.87□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 ROM2YLR371W 4071 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 PBY1YBR094W 2262 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SEC21YNL287W 2808 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RAD34YDR314C 2079 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YIR044CYIR044C 186 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 PCC1YKR095W-A 267 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RRT15YLR162W-A 189 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YAR053WYAR053W 297 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 NUP145YGL092W 3954 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 APL3YBL037W 3078 nt0.86□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 LCD1YDR499W 2244 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SEC3YER008C 4011 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 AIM44YPL158C 2277 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 COG4YPR105C 2586 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 SIP4YJL089W 2490 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YLR334CYLR334C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YBR012CYBR012C 420 nt0.85□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 IFH1YLR223C 3258 nt0.84□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 RSM22YKL155C 1887 nt0.84□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.84□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YOR029WYOR029W 336 nt0.84□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 YPR063CYPR063C 423 nt0.84□□□□□ -2.27
RDS3Q06835 MMS4YBR098W 2076 nt0.84□□□□□ -2.28
RDS3Q06835 PAN2YGL094C 3348 nt0.83□□□□□ -2.28
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