Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KDSRQ06136 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms