Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms