Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 NUP157YER105C 4176 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 MRPL31YKL138C 396 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 UPS1YLR193C 528 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YLR287CYLR287C 1068 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 LOA1YPR139C 903 nt1.07□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YDL011CYDL011C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 SRP14YDL092W 441 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YBL071CYBL071C 309 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 NUT2YPR168W 474 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 SCW11YGL028C 1629 nt1.06□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 TTI1YKL033W 3117 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 MMS4YBR098W 2076 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.05□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 snR14snR14 160 nt1.04□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.03□□□□□ -2.24
YMR111CQ04461 AIM9YER080W 1884 nt1.03□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 SPT7YBR081C 3999 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 FYV7YLR068W 456 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 SLI15YBR156C 2097 nt1.02□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YLR101CYLR101C 396 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 RRT1YBL048W 312 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 IRC23YOR044W 474 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YPL229WYPL229W 621 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 ZIP2YGL249W 2115 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 MYO1YHR023W 5787 nt1.01□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 NPC2YDL046W 522 nt1□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 STF2YGR008C 255 nt1□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 PDE2YOR360C 1581 nt1□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 LCD1YDR499W 2244 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YPL261CYPL261C 309 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 PAN2YGL094C 3348 nt0.99□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 CYC7YEL039C 342 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 YKL063CYKL063C 504 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 CDC33YOL139C 642 nt0.98□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 SMC1YFL008W 3678 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 HUG1YML058W-A 207 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 RIM20YOR275C 1986 nt0.97□□□□□ -2.25
YMR111CQ04461 SET3YKR029C 2256 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YIR044CYIR044C 186 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 HCH1YNL281W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 ATP19YOL077W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 snR41snR41 95 nt0.96□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YAR009CYAR009C 3591 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 FIG4YNL325C 2640 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YJL007CYJL007C 315 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YOR199WYOR199W 330 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 RPB10YOR210W 213 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.95□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YNL058CYNL058C 951 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YOL160WYOL160W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YJR003CYJR003C 1560 nt0.94□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 GPG1YGL121C 381 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 MRPL50YNR022C 420 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 Q0017Q0017 162 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 STO1YMR125W 2586 nt0.93□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 COG4YPR105C 2586 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 CBS1YDL069C 690 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YJL135WYJL135W 318 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YAR047CYAR047C 321 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 YDL206WYDL206W 2289 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 UBP3YER151C 2739 nt0.92□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 WIP1YDR374W-A 270 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 TOM22YNL131W 459 nt0.91□□□□□ -2.26
YMR111CQ04461 SDH7YDR511W 402 nt0.9□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YKL083WYKL083W 615 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 PAU24YBR301W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 snR51snR51 107 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 CUL3YGR003W 2235 nt0.89□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 INP2YMR163C 2118 nt0.88□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 RAD34YDR314C 2079 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 WAR1YML076C 2835 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 RPS24BYIL069C 408 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YOR029WYOR029W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 PKH2YOL100W 3246 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YLR456WYLR456W 615 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 LTE1YAL024C 4308 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 RKR1YMR247C 4689 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 ISD11YER048W-A 285 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 UBC7YMR022W 498 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 PTP2YOR208W 2253 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YHL042WYHL042W 453 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 PAM16YJL104W 450 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 RPL38YLR325C 237 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 YPL185WYPL185W 396 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR111CQ04461 PCF11YDR228C 1881 nt0.84□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 SLD3YGL113W 2007 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YDL196WYDL196W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YAP6YDR259C 1152 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YPL205CYPL205C 345 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 PAC1YOR269W 1485 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1806.6 ms