Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms