Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms