Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms