Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms