Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms