Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FGD1P98174 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms