Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED6P86452 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms