Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX3P78415 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX3P78415 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX3P78415 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX3P78415 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX3P78415 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX3P78415 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX3P78415 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms