Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNTNAP1P78357 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP1P78357 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms