Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms