Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPD3P62318 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms