Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPFP62306 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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