Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMC1P62191 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMC1P62191 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms