Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP6P59044 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms