Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 LCL1YPL056C 306 nt1.69□□□□□ -2.14
GIS2P53849 KSP1YHR082C 3090 nt1.69□□□□□ -2.14
GIS2P53849 AIM44YPL158C 2277 nt1.68□□□□□ -2.14 RIP-Chip
GIS2P53849 SLY1YDR189W 2001 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YDR239CYDR239C 2364 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 PAU3YCR104W 375 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 KTI11YBL071W-A 249 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 PSY2YNL201C 2577 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 MNE1YOR350C 1992 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 ATG11YPR049C 3537 nt1.68□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YPR089WYPR089W 2667 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 NOC3YLR002C 1992 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 HRD3YLR207W 2502 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 IKI3YLR384C 4050 nt1.67□□□□□ -2.14 RIP-Chip
GIS2P53849 YCR043CYCR043C 384 nt1.67□□□□□ -2.14 RIP-Chip
GIS2P53849 EMP24YGL200C 612 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 RPL20AYMR242C 519 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YOR055WYOR055W 435 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YPR203WYPR203W 309 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YCL046WYCL046W 324 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 PUT3YKL015W 2940 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 CTF4YPR135W 2784 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 DNL4YOR005C 2835 nt1.67□□□□□ -2.14
GIS2P53849 SWI5YDR146C 2130 nt1.66□□□□□ -2.14
GIS2P53849 FMP16YDR070C 282 nt1.66□□□□□ -2.14
GIS2P53849 snR45snR45 172 nt1.66□□□□□ -2.14
GIS2P53849 YKU80YMR106C 1890 nt1.66□□□□□ -2.14
GIS2P53849 PBY1YBR094W 2262 nt1.65□□□□□ -2.14
GIS2P53849 PDR1YGL013C 3207 nt1.65□□□□□ -2.14
GIS2P53849 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.65□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YBR206WYBR206W 324 nt1.65□□□□□ -2.15
GIS2P53849 UTP14YML093W 2700 nt1.65□□□□□ -2.15 RIP-Chip
GIS2P53849 RIC1YLR039C 3171 nt1.65□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SMY2YBR172C 2223 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SUL1YBR294W 2580 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 TRA1YHR099W 11235 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PRP6YBR055C 2700 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SMC2YFR031C 3513 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YDR209CYDR209C 414 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SOM1YEL059C-A 225 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SWR1YDR334W 4545 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PRP8YHR165C 7242 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 LYS14YDR034C 2373 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 STB4YMR019W 2850 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 TAE2YPL009C 3117 nt1.64□□□□□ -2.15 RIP-Chip
GIS2P53849 MMS1YPR164W 4224 nt1.64□□□□□ -2.15
GIS2P53849 MLH1YMR167W 2310 nt1.63□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SCH9YHR205W 2475 nt1.63□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YDL118WYDL118W 381 nt1.63□□□□□ -2.15
GIS2P53849 HOS4YIL112W 3252 nt1.63□□□□□ -2.15
GIS2P53849 VMR1YHL035C 4779 nt1.63□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PIP2YOR363C 2991 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 MNL2YLR057W 2550 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 RPL31AYDL075W 342 nt1.62□□□□□ -2.15 RIP-Chip
GIS2P53849 BNI1YNL271C 5862 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 NUP100YKL068W 2880 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YOR019WYOR019W 2193 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SPO22YIL073C 2928 nt1.62□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SVL3YPL032C 2478 nt1.61□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.61□□□□□ -2.15
GIS2P53849 ANS1YHR126C 480 nt1.61□□□□□ -2.15
GIS2P53849 EDS1YBR033W 2760 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 INP53YOR109W 3324 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 RGA2YDR379W 3030 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SNC1YAL030W 354 nt1.6□□□□□ -2.15 RIP-Chip
GIS2P53849 PAU8YAL068C 363 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PAU18YLL064C 363 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PAU6YNR076W 363 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 PAU20YOL161C 363 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 RPS30BYOR182C 192 nt1.6□□□□□ -2.15
GIS2P53849 SPF1YEL031W 3648 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 IRR1YIL026C 3453 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 CRM1YGR218W 3255 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 AFI1YOR129C 2682 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 GCV2YMR189W 3105 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt1.59□□□□□ -2.15
GIS2P53849 YNL144CYNL144C 2223 nt1.59□□□□□ -2.16
GIS2P53849 NET1YJL076W 3570 nt1.59□□□□□ -2.16
GIS2P53849 SLD3YGL113W 2007 nt1.59□□□□□ -2.16
GIS2P53849 SBE22YHR103W 2559 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 TOR2YKL203C 7425 nt1.58□□□□□ -2.16 RIP-Chip
GIS2P53849 CAT2YML042W 2013 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 RAD34YDR314C 2079 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 DUG2YBR281C 2637 nt1.58□□□□□ -2.16
GIS2P53849 RGR1YLR071C 3249 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 SLM1YIL105C 2061 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 KIP1YBL063W 3336 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 SET2YJL168C 2202 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 STF2YGR008C 255 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 DSE4YNR067C 3354 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 VPS16YPL045W 2397 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 ZIP2YGL249W 2115 nt1.57□□□□□ -2.16
GIS2P53849 NAM7YMR080C 2916 nt1.56□□□□□ -2.16
GIS2P53849 CHS6YJL099W 2241 nt1.56□□□□□ -2.16
GIS2P53849 VPS13YLL040C 9435 nt1.56□□□□□ -2.16
GIS2P53849 PHO91YNR013C 2685 nt1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.3 ms