Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOSBP53539 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOSBP53539 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOSBP53539 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOSBP53539 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms