Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACLYP53396 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACLYP53396 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACLYP53396 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms