Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms