Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 EMC5YIL027C 426 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YKL083WYKL083W 615 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RPS27AYKL156W 249 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 ZIP1YDR285W 2628 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 UFD2YDL190C 2886 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YLL054CYLL054C 2532 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 MRPL31YKL138C 396 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RPL40BYKR094C 387 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YPL229WYPL229W 621 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 NUT2YPR168W 474 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 ENV11YGR071C 2583 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 SWI6YLR182W 2412 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YLL032CYLL032C 2478 nt1.05□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RPL34BYIL052C 366 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YIL059CYIL059C 366 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 UPS1YLR193C 528 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YOR121CYOR121C 306 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YPR063CYPR063C 423 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RAD50YNL250W 3939 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 MSN5YDR335W 3675 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
SYF2P53277 MUK1YPL070W 1839 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 EFR3YMR212C 2349 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 ATG31YDR022C 591 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 TIM18YOR297C 579 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YSY6YBR162W-A 198 nt1.03□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YDL211CYDL211C 1119 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF2P53277 PIG1YLR273C 1947 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF2P53277 PAC1YOR269W 1485 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF2P53277 IML1YJR138W 4755 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SEC3YER008C 4011 nt1.02□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SPT7YBR081C 3999 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YGL217CYGL217C 342 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF2P53277 snR14snR14 160 nt1.01□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SLX4YLR135W 2247 nt1□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1□□□□□ -2.25
SYF2P53277 snR51snR51 107 nt1□□□□□ -2.25
SYF2P53277 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1□□□□□ -2.25
SYF2P53277 APL2YKL135C 2181 nt1□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SGO1YOR073W 1773 nt0.99□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SPO75YLL005C 2607 nt0.99□□□□□ -2.25
SYF2P53277 COG4YPR105C 2586 nt0.99□□□□□ -2.25
SYF2P53277 STF2YGR008C 255 nt0.99□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.99□□□□□ -2.25
SYF2P53277 APL1YJR005W 2103 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 snR72snR72 98 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YLL020CYLL020C 306 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SDH2YLL041C 801 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 IRC23YOR044W 474 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YPR012WYPR012W 255 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 NUT1YGL151W 3399 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 NUP188YML103C 4968 nt0.98□□□□□ -2.25
SYF2P53277 CLU1YMR012W 3834 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 CSN9YDR179C 489 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YOR199WYOR199W 330 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 SLY1YDR189W 2001 nt0.97□□□□□ -2.25
SYF2P53277 VPS54YDR027C 2670 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 RPS20YHL015W 366 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YJL135WYJL135W 318 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YLR334CYLR334C 381 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 HUG1YML058W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 RPB10YOR210W 213 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 SAS3YBL052C 2496 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YJR003CYJR003C 1560 nt0.96□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YAR053WYAR053W 297 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YNL058CYNL058C 951 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF2P53277 NOC3YLR002C 1992 nt0.95□□□□□ -2.26
SYF2P53277 ZIP2YGL249W 2115 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF2P53277 SCW11YGL028C 1629 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YOL160WYOL160W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF2P53277 INP2YMR163C 2118 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF2P53277 ROM2YLR371W 4071 nt0.94□□□□□ -2.26
SYF2P53277 EAF1YDR359C 2949 nt0.93□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YGR035CYGR035C 351 nt0.93□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YPL261CYPL261C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
SYF2P53277 CDC39YCR093W 6327 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 NPC2YDL046W 522 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 SLD3YGL113W 2007 nt0.92□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YDR426CYDR426C 378 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 RPL38YLR325C 237 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 NIP100YPL174C 2607 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 AIM44YPL158C 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 UBP3YER151C 2739 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 NST1YNL091W 3723 nt0.91□□□□□ -2.26
SYF2P53277 YCS4YLR272C 3531 nt0.9□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms