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Protein–RNA interactions for Protein: P53238
PEF1, Peflin, yeast
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335 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
PEF1
P53238
INO80
YGL150C
4470 nt
1.96
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YBL012C
YBL012C
402 nt
1.96
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
ABF2
YMR072W
552 nt
1.96
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
1.96
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
MPT5
YGL178W
2580 nt
1.95
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
JLP2
YMR132C
627 nt
1.95
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
SEY1
YOR165W
2331 nt
1.95
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
SPC98
YNL126W
2541 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YCK3
YER123W
1575 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
NIP100
YPL174C
2607 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
CDC36
YDL165W
576 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YJL197C-A
YJL197C-A
282 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
SIR4
YDR227W
4077 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
SEC63
YOR254C
1992 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
DGR2
YKL121W
2559 nt
1.94
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
TOR2
YKL203C
7425 nt
1.93
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
snR55
snR55
98 nt
1.93
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YGL052W
YGL052W
306 nt
1.93
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
1.93
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
BUD2
YKL092C
3315 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
APL2
YKL135C
2181 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
PUT3
YKL015W
2940 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
ENV11
YGR071C
2583 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
ATP7
YKL016C
525 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YLR120W-A
YLR120W-A
102 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YOR015W
YOR015W
360 nt
1.92
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
PIG1
YLR273C
1947 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
PDR8
YLR266C
2106 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
GCN2
YDR283C
4980 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
MAD1
YGL086W
2250 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
PDE2
YOR360C
1581 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
YMR172C-A
YMR172C-A
384 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
SAP190
YKR028W
3102 nt
1.91
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
RAD34
YDR314C
2079 nt
1.9
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.9
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
ATG11
YPR049C
3537 nt
1.9
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
NUP170
YBL079W
4509 nt
1.9
□□□□□ -2.1
PEF1
P53238
RPL34B
YIL052C
366 nt
1.9
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YMR321C
YMR321C
318 nt
1.9
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YNL144C
YNL144C
2223 nt
1.9
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
MGA2
YIR033W
3342 nt
1.89
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
UBR2
YLR024C
5619 nt
1.89
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
PAU2
YEL049W
363 nt
1.89
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
tM(CAU)Q1
tM(CAU)Q1
76 nt
1.89
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
VPS54
YDR027C
2670 nt
1.89
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
ATG9
YDL149W
2994 nt
1.88
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
1.88
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
TFC3
YAL001C
3483 nt
1.88
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
BLI1
YKL061W
342 nt
1.87
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
DGR1
YNL130C-A
147 nt
1.87
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
IES4
YOR189W
351 nt
1.87
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
SFB2
YNL049C
2631 nt
1.86
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
GPG1
YGL121C
381 nt
1.86
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
RPS27B
YHR021C
249 nt
1.86
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YJL052C-A
YJL052C-A
120 nt
1.86
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YOR218C
YOR218C
420 nt
1.86
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
UTP21
YLR409C
2820 nt
1.85
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
NOC3
YLR002C
1992 nt
1.85
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
PFD1
YJL179W
330 nt
1.85
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YBL008W-A
YBL008W-A
240 nt
1.84
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
1.84
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
1.84
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
YJR039W
YJR039W
3366 nt
1.84
□□□□□ -2.11
PEF1
P53238
NPR2
YEL062W
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1.84
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
BRE1
YDL074C
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1.84
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
UTP22
YGR090W
3714 nt
1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
PAU3
YCR104W
375 nt
1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
TMA7
YLR262C-A
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1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YMR247W-A
YMR247W-A
144 nt
1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YPR092W
YPR092W
306 nt
1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
LHS1
YKL073W
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1.83
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
SPO75
YLL005C
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□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
FKS1
YLR342W
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1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
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PEF1
P53238
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□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
RPL31A
YDL075W
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□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
tF(GAA)Q
tF(GAA)Q
75 nt
1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
tT(UGU)H
tT(UGU)H
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1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YHR210C
YHR210C
1026 nt
1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
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YIR044C
186 nt
1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
RPS25B
YLR333C
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1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
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YCL023C
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1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
SPO21
YOL091W
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1.82
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
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YLL007C
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1.81
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
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YDR406W-A
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1.81
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PEF1
P53238
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YOR011W-A
207 nt
1.81
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YFR016C
YFR016C
3702 nt
1.8
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YJL120W
YJL120W
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1.8
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
YMR230W-A
YMR230W-A
189 nt
1.8
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
PTP2
YOR208W
2253 nt
1.79
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
SPO24
YPR036W-A
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1.79
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
SEC5
YDR166C
2916 nt
1.78
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
SLI15
YBR156C
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1.78
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
MCM10
YIL150C
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1.78
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
RAD50
YNL250W
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1.78
□□□□□ -2.12
PEF1
P53238
IRC20
YLR247C
4671 nt
1.78
□□□□□ -2.13
PEF1
P53238
snR74
snR74
88 nt
1.77
□□□□□ -2.13
PEF1
P53238
APQ12
YIL040W
417 nt
1.77
□□□□□ -2.13
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