Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms