Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETV1P50549 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms