Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF6P49848 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF6P49848 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF6P49848 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms