Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTPAP49638 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTPAP49638 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTPAP49638 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTPAP49638 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TTPAP49638 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTPAP49638 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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TTPAP49638 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TTPAP49638 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TTPAP49638 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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