Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU3F4P49335 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms