Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REG1BP48304 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REG1BP48304 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REG1BP48304 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms