Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CRATP43155 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRATP43155 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRATP43155 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRATP43155 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms