Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A4P43007 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms