Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 VPS8YAL002W 3825 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 APL5YPL195W 2799 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YNL018CYNL018C 1839 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 RPL31AYDL075W 342 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 NOP14YDL148C 2433 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 BUB1YGR188C 3066 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 AIM44YPL158C 2277 nt2.52□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 SRB8YCR081W 4284 nt2.51□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 TRA1YHR099W 11235 nt2.51□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 MAD1YGL086W 2250 nt2.51□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 SAS3YBL052C 2496 nt2.5□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 CAF120YNL278W 3183 nt2.5□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 ZIP1YDR285W 2628 nt2.5□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 MET18YIL128W 3099 nt2.5□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 FLO11YIR019C 4104 nt2.49□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 AHC1YOR023C 1701 nt2.49□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 LCL1YPL056C 306 nt2.49□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.49□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 SEC26YDR238C 2922 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YOR102WYOR102W 351 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 PIP2YOR363C 2991 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YPL150WYPL150W 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 APL2YKL135C 2181 nt2.47□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.47□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 YJL022WYJL022W 309 nt2.47□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 BNR1YIL159W 4128 nt2.47□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 SMC6YLR383W 3345 nt2.47□□□□□ -2.01
YAR028WP39548 TRS130YMR218C 3309 nt2.46□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YDR209CYDR209C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 KTI11YBL071W-A 249 nt2.46□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 DCP2YNL118C 2913 nt2.46□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 TUS1YLR425W 3924 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 TCB2YNL087W 3537 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YPL044CYPL044C 549 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 PSD2YGR170W 3417 nt2.45□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 ARP8YOR141C 2646 nt2.44□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 UBR1YGR184C 5853 nt2.43□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YDR544CYDR544C 429 nt2.43□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 PTP2YOR208W 2253 nt2.43□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 SLD3YGL113W 2007 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 MAK10YEL053C 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 NUP100YKL068W 2880 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 PHO91YNR013C 2685 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 DGR2YKL121W 2559 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 IFH1YLR223C 3258 nt2.42□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YDR341CYDR341C 1824 nt2.41□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 MSH5YDL154W 2706 nt2.41□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 DBP10YDL031W 2988 nt2.41□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 ISW1YBR245C 3390 nt2.41□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.4□□□□□ -2.02
YAR028WP39548 PDR1YGL013C 3207 nt2.4□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 PBY1YBR094W 2262 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 TFB5YDR079C-A 219 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 RPS29AYLR388W 171 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YMR326CYMR326C 309 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 MLH3YPL164C 2148 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 FAR11YNL127W 2862 nt2.39□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YOR055WYOR055W 435 nt2.38□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YDR239CYDR239C 2364 nt2.38□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 MLH1YMR167W 2310 nt2.37□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 CTF4YPR135W 2784 nt2.37□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YDR521WYDR521W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 RPS17AYML024W 411 nt2.37□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 SBE22YHR103W 2559 nt2.37□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 SVL3YPL032C 2478 nt2.36□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 SPF1YEL031W 3648 nt2.36□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 ALK1YGL021W 2283 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 TOP2YNL088W 4287 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 RPS30BYOR182C 192 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 EDS1YBR033W 2760 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 RSE1YML049C 4086 nt2.35□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 SAP185YJL098W 3177 nt2.34□□□□□ -2.03
YAR028WP39548 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 COX12YLR038C 252 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YBR206WYBR206W 324 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 SAP190YKR028W 3102 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 HMI1YOL095C 2121 nt2.33□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 TRL1YJL087C 2484 nt2.32□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 IRA2YOL081W 9240 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 AGC1YPR021C 2709 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 PAA1YDR071C 576 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 CDC31YOR257W 486 nt2.31□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 SGM1YJR134C 2124 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 STE11YLR362W 2154 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 SYH1YPL105C 2550 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 BUD2YKL092C 3315 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 GIP3YPL137C 3831 nt2.3□□□□□ -2.04
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