Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 NIP100YPL174C 2607 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 IST2YBR086C 2841 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 VPS54YDR027C 2670 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 DGR1YNL130C-A 147 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 MSC6YOR354C 2079 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YFR016CYFR016C 3702 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 UFD4YKL010C 4452 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 PDR3YBL005W 2931 nt2.11□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 SPC98YNL126W 2541 nt2.11□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.11□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.11□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 MLH3YPL164C 2148 nt2.11□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 HER1YOR227W 3741 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 HSH155YMR288W 2916 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 PAM16YJL104W 450 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YCL023CYCL023C 348 nt2.1□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 CAT2YML042W 2013 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 RLM1YPL089C 2031 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 VTC1YER072W 390 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 COA4YLR218C 453 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YOR218CYOR218C 420 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YOR302WYOR302W 78 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YPR092WYPR092W 306 nt2.09□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 BRE1YDL074C 2103 nt2.09□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 PUT3YKL015W 2940 nt2.09□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 MSH5YDL154W 2706 nt2.09□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 FRK1YPL141C 2598 nt2.08□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 AGC1YPR021C 2709 nt2.08□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 RPS27BYHR021C 249 nt2.08□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 BUD2YKL092C 3315 nt2.08□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 NEO1YIL048W 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 SAP190YKR028W 3102 nt2.07□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.07□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 RPL34BYIL052C 366 nt2.07□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YNL198CYNL198C 303 nt2.07□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 RAD34YDR314C 2079 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 SKP2YNL311C 2292 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 Q0032Q0032 291 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YDL118WYDL118W 381 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 MBB1YJL199C 327 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 RRT15YLR162W-A 189 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 APL2YKL135C 2181 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 MAD1YGL086W 2250 nt2.06□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.05□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 ATP7YKL016C 525 nt2.05□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 DGR2YKL121W 2559 nt2.05□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 SEC5YDR166C 2916 nt2.04□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.04□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 ENV11YGR071C 2583 nt2.04□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.04□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 SEY1YOR165W 2331 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 ISD11YER048W-A 285 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 VPS55YJR044C 423 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 SLN1YIL147C 3663 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 PIG1YLR273C 1947 nt2.03□□□□□ -2.08
SSZ1P38788 INO80YGL150C 4470 nt2.03□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 MSH6YDR097C 3729 nt2.02□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.02□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 LRE1YCL051W 1752 nt2.02□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SCP160YJL080C 3669 nt2.02□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 MYO4YAL029C 4416 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SPO75YLL005C 2607 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 MCM10YIL150C 1716 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 snR74snR74 88 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 OLI1Q0130 231 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 RPS25BYLR333C 327 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 NOC3YLR002C 1992 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SEC63YOR254C 1992 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 HIR3YJR140C 4947 nt2.01□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YLL007CYLL007C 1998 nt2□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 BPH1YCR032W 6504 nt2□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YIR044CYIR044C 186 nt2□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 MYO2YOR326W 4725 nt2□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SPO21YOL091W 1830 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YEL014CYEL014C 306 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SGF11YPL047W 300 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 UTP22YGR090W 3714 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 CUL3YGR003W 2235 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 HSL1YKL101W 4557 nt1.99□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YKU70YMR284W 1809 nt1.98□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YJL120WYJL120W 324 nt1.98□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YJL182CYJL182C 318 nt1.98□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 YNL144CYNL144C 2223 nt1.98□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 PTP2YOR208W 2253 nt1.97□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 snR70snR70 164 nt1.97□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 RPL31AYDL075W 342 nt1.97□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 SEC31YDL195W 3822 nt1.97□□□□□ -2.09
SSZ1P38788 PDR8YLR266C 2106 nt1.96□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.96□□□□□ -2.1
SSZ1P38788 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.96□□□□□ -2.1
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