Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2IP36954 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms