Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL4P36578 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms