Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms