Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms